当超算遇见“国宝”,国家超算成都中心与成都大熊猫繁育研究基地签署战略合作协议

10月19日,国家超算成都中心与成都大熊猫繁育研究基地在蓉举行战略合作签约仪式和濒危动物遗传与计算创新中心揭牌仪式。红星新闻记者了解到,未来,双方将更好地发挥各自在技术、科学研究等方面的优势,运用前沿信息技术突破科研技术瓶颈,共同探索超级计算在大熊猫等濒危物种保护、大熊猫国家公园建设、数字化生态等多个科研和应用领域的无限可能,推动产业创新发展和科技成果转化

10月19日,国家超算成都中心与成都大熊猫繁育研究基地在蓉举行战略合作签约仪式和濒危动物遗传与计算创新中心揭牌仪式。

红星新闻记者了解到,未来,双方将更好地发挥各自在技术、科学研究等方面的优势,运用前沿信息技术突破科研技术瓶颈,共同探索超级计算在大熊猫等濒危物种保护、大熊猫国家公园建设、数字化生态等多个科研和应用领域的无限可能,推动产业创新发展和科技成果转化。

签署战略合作协议

濒危动物遗传与计算创新中心正式揭牌

现场,国家超算成都中心与成都大熊猫繁育研究基地签署了战略合作协议,濒危动物遗传与计算创新中心正式揭牌。

成都数据集团董事长冉皓表示,国家超算成都中心是推动科技进步、经济发展的战略高地,是国家科技创新的战略平台。此次合作,国家超算成都中心将充分发挥自身软硬件优势,携手成都大熊猫繁育研究基地,搭建“濒危动物遗传大数据计算平台”,围绕大熊猫的基因组学大数据、遗传多样性等项目开展深入研究,为我国大熊猫和濒危野生动物的繁育及保护提供有力支持。

近年来,随着人工繁育大熊猫数量快速优质增长,我国大熊猫保护已取得初步成效。但野生大熊猫仍然面临着栖息地丧失和退化、遗传多样性降低等威胁,开展大熊猫种群的遗传多样性研究对大熊猫等濒危野生动物的长期生存至关重要。

然而,大熊猫基因序列及遗传多样性数据计算总量大、任务多,对计算和存储要求高。为了突破这一数据算力瓶颈,双方将依托濒危动物遗传与计算创新中心,整合遗传学和计算科学的力量,通过超算极大缩短大熊猫基因序列、基因结构等数据的计算时间,帮助科研人员更高效、更全面、更精确地了解濒危动物的遗传数据,从而制定科学有效的保护计划。

成都大熊猫繁育研究基地主任尹志东在致词中提到,双方的联合将搭建起超级计算支持自然科学研究的桥梁,编制出新型智能计算运用与珍稀濒危物种保护科研的纽带,释放数据要素新动能,筑强算力底座新支撑,为我国生态文明建设和构建创新驱动新引擎做出积极贡献。

算力赋能

超算如何融入大熊猫保护工作?

现场,成都大熊猫繁育研究基地濒危野生动物就地保护遗传研究室主任王也围绕成都超算在大熊猫保护中的应用进行了分享。

“我们正在经历第六次生物大灭绝,物种消亡速度比自然状态下高出100倍。”王也介绍道,根据全国第四次大熊猫野外调查,现有野生大熊猫为1864只,分离为33个种群,其中15个种群灭绝风险高达90%。如果在没有任何干预的情况下,这33个孤立小种群有可能进一步分化为更多个种群,灭绝风险更高。从圈养种群来看,截至2022年12月,圈养大熊猫数量已经达到698只。历经几十年,在几代人的不懈努力下,2022年大熊猫的濒危等级从“濒危”降为“易危”。

那么,大熊猫是如何被保护的?王也提及,大熊猫核心手段是就地保护和迁地保护。就地保护主要是自然生态系统保护,以及自然保护地建立。迁地保护是直接作用于被保护物种,构建可自我维持的圈养种群。这两者并非完全割裂,做迁地保护的最终目标是就地保护。

“事实上,大熊猫保护理论与AI进化高度相似。我们能否用AI模拟大熊猫放归过程?超算如何融入大熊猫保护工作?”王也给出的关键词是“精准”。他举例,在迁地保护上,可以借助超算从基于谱系管理到基于遗传元件的精准管理,疾病精准治疗与防控;在就地保护上,可以借助超算从复杂生态系统中精准获取遗传信息,从庞大微生物系统中精准监控致病体。

事实上,成都超算中心的技术已成功运用到大熊猫的就地保护中,助力大熊猫野外精准调查。例如,利用“粪便DNA靶向捕获技术”,突破陈旧粪便遗传鉴定难题,为大熊猫野外精准调查提供新技术。而在迁地保护上,成都超算中心正在助力大熊猫病原广谱筛查。王也表示,在没有超算助力的情况下,以前计算数据都需一周时间。在超算助力下,这个时间在理论上可以缩短至24小时。

在王也看来,生物多样性保护新技术、新方法将更依赖超级计算,超级计算将从各个层面促进保护工作的精准化,是未来生物多样性保护工作的基础工具之一。

红星新闻记者 彭祥萍

编辑 成序

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